随着全球经济的不断发展，越来越多的企业选择在香港注册公司，并在中国大陆开展业务。然而，对于这些在香港注册的公司在大陆经营是否合法的问题，一直存在着一些争议和疑虑。本文将从法律角度出发，对这一问题进行探讨。

首先，需要明确的是，香港和中国大陆虽然属于同一个国家，但在法律体系上存在着一定的差异。香港是一个特别行政区，享有高度自治权，拥有独立的法律体系。而中国大陆则是一个社会主义国家，法律体系以中华人民共和国法律为基础。因此，香港注册的公司在大陆经营是否合法，需要根据两地的法律规定来进行判断。

根据中国大陆的法律规定，外国企业在大陆经营需要进行注册，并获得相应的许可证。外国企业包括在香港注册的公司。根据《中华人民共和国外资企业法》的规定，外国企业在大陆经营必须符合以下条件：首先，必须经过批准并取得外商投资企业批准证书；其次，必须在大陆注册并取得营业执照；最后，必须按照法律规定进行税务登记和报税。只有符合这些条件的外国企业才能在大陆合法经营。

那么，香港注册的公司是否满足这些条件呢？根据《中华人民共和国香港特别行政区基本法》的规定，香港特别行政区享有高度自治权，包括自行管理和控制经济事务的权力。因此，香港注册的公司在大陆经营需要遵守中国大陆的法律规定，进行相应的注册和许可手续。如果香港注册的公司未经注册和许可就在大陆经营，将被视为违法行为。

此外，根据《中华人民共和国公司法》的规定，外国企业在大陆经营必须设立分支机构或者办事处，并在大陆进行备案登记。这意味着，香港注册的公司在大陆经营需要在当地设立分支机构或者办事处，并进行备案登记。如果未经备案登记就在大陆经营，将被视为违法行为。

综上所述，香港注册的公司在大陆经营是否违法，取决于其是否符合中国大陆的法律规定。根据中国大陆的法律规定，外国企业在大陆经营需要进行注册、取得许可证，并设立分支机构或者办事处进行备案登记。如果香港注册的公司未经注册、许可和备案登记就在大陆经营，将被视为违法行为。因此，香港注册的公司在大陆经营时务必遵守中国大陆的法律规定，进行相应的注册和许可手续，以确保合法经营。

总结起来，香港注册的公司在大陆经营并不违法，但需要符合中国大陆的法律规定，进行相应的注册、许可和备案登记。只有遵守法律规定，才能保证在大陆的经营合法性。因此，对于在香港注册的公司来说，了解并遵守中国大陆的法律规定是非常重要的，以确保经营的合法性和稳定性。